Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC6Q16204 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC6Q16204 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
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