Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP1Q15431 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SYCP1Q15431 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP1Q15431 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
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