Protein–RNA interactions for Protein: Q15428

SF3A2, Splicing factor 3A subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A2Q15428 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
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