Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HERC3Q15034 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERC3Q15034 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms