Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LAPTM4AQ15012 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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LAPTM4AQ15012 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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LAPTM4AQ15012 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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LAPTM4AQ15012 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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LAPTM4AQ15012 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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LAPTM4AQ15012 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LAPTM4AQ15012 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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