Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN4

KRT72, Keratin, type II cytoskeletal 72, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT72Q14CN4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT72Q14CN4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT72Q14CN4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT72Q14CN4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT72Q14CN4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT72Q14CN4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT72Q14CN4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT72Q14CN4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT72Q14CN4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT72Q14CN4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT72Q14CN4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT72Q14CN4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT72Q14CN4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT72Q14CN4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT72Q14CN4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT72Q14CN4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT72Q14CN4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT72Q14CN4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT72Q14CN4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT72Q14CN4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT72Q14CN4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT72Q14CN4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT72Q14CN4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT72Q14CN4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT72Q14CN4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT72Q14CN4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT72Q14CN4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT72Q14CN4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT72Q14CN4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT72Q14CN4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT72Q14CN4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT72Q14CN4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT72Q14CN4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms