Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA3AQ14563 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA3AQ14563 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
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