Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN5AQ14524 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
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