Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE1CQ14123 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE1CQ14123 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE1CQ14123 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE1CQ14123 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE1CQ14123 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE1CQ14123 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE1CQ14123 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE1CQ14123 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE1CQ14123 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE1CQ14123 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE1CQ14123 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDE1CQ14123 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE1CQ14123 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
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