Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1DQ13901 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1DQ13901 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1DQ13901 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C1DQ13901 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C1DQ13901 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C1DQ13901 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C1DQ13901 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C1DQ13901 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
C1DQ13901 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
C1DQ13901 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
C1DQ13901 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
C1DQ13901 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C1DQ13901 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C1DQ13901 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C1DQ13901 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1DQ13901 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1DQ13901 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1DQ13901 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1DQ13901 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1DQ13901 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1DQ13901 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1DQ13901 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1DQ13901 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1DQ13901 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1DQ13901 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1DQ13901 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1DQ13901 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1DQ13901 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1DQ13901 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1DQ13901 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1DQ13901 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1DQ13901 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1DQ13901 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1DQ13901 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1DQ13901 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1DQ13901 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1DQ13901 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1DQ13901 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1DQ13901 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1DQ13901 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1DQ13901 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1DQ13901 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
C1DQ13901 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1DQ13901 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1DQ13901 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1DQ13901 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1DQ13901 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1DQ13901 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1DQ13901 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1DQ13901 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1DQ13901 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1DQ13901 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1DQ13901 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1DQ13901 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
C1DQ13901 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1DQ13901 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1DQ13901 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
C1DQ13901 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1DQ13901 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1DQ13901 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1DQ13901 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1DQ13901 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
C1DQ13901 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1DQ13901 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1DQ13901 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1DQ13901 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1DQ13901 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1DQ13901 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C1DQ13901 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C1DQ13901 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C1DQ13901 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C1DQ13901 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C1DQ13901 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C1DQ13901 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C1DQ13901 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C1DQ13901 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C1DQ13901 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C1DQ13901 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C1DQ13901 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C1DQ13901 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
C1DQ13901 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
C1DQ13901 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C1DQ13901 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1DQ13901 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1DQ13901 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1DQ13901 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1DQ13901 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1DQ13901 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1DQ13901 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1DQ13901 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
C1DQ13901 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
C1DQ13901 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1DQ13901 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1DQ13901 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1DQ13901 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1DQ13901 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1DQ13901 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1DQ13901 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1DQ13901 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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