Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PKP1Q13835 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PKP1Q13835 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKP1Q13835 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
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