Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBA3CQ13748 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA3CQ13748 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms