Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CUL1Q13616 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
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