Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BFSP2Q13515 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BFSP2Q13515 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
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