Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTM1Q13496 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTM1Q13496 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTM1Q13496 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTM1Q13496 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTM1Q13496 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTM1Q13496 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTM1Q13496 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTM1Q13496 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTM1Q13496 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTM1Q13496 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTM1Q13496 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTM1Q13496 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTM1Q13496 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTM1Q13496 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTM1Q13496 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTM1Q13496 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTM1Q13496 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTM1Q13496 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MTM1Q13496 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTM1Q13496 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTM1Q13496 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTM1Q13496 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTM1Q13496 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTM1Q13496 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTM1Q13496 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTM1Q13496 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTM1Q13496 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTM1Q13496 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MTM1Q13496 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTM1Q13496 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
MTM1Q13496 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MTM1Q13496 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTM1Q13496 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MTM1Q13496 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133 ms