Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SMAD4Q13485 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAD4Q13485 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
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