Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XRCC4Q13426 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XRCC4Q13426 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
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