Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLAMF1Q13291 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLAMF1Q13291 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLAMF1Q13291 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLAMF1Q13291 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLAMF1Q13291 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLAMF1Q13291 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLAMF1Q13291 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLAMF1Q13291 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLAMF1Q13291 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLAMF1Q13291 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLAMF1Q13291 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLAMF1Q13291 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLAMF1Q13291 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLAMF1Q13291 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLAMF1Q13291 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLAMF1Q13291 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLAMF1Q13291 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLAMF1Q13291 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLAMF1Q13291 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms