Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTGDRQ13258 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTGDRQ13258 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTGDRQ13258 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
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