Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MKRN3Q13064 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MKRN3Q13064 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MKRN3Q13064 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
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