Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMAN2Q12907 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LMAN2Q12907 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMAN2Q12907 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMAN2Q12907 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMAN2Q12907 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMAN2Q12907 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMAN2Q12907 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMAN2Q12907 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LMAN2Q12907 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMAN2Q12907 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMAN2Q12907 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMAN2Q12907 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMAN2Q12907 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMAN2Q12907 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMAN2Q12907 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMAN2Q12907 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMAN2Q12907 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMAN2Q12907 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LMAN2Q12907 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMAN2Q12907 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMAN2Q12907 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMAN2Q12907 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMAN2Q12907 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMAN2Q12907 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMAN2Q12907 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LMAN2Q12907 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMAN2Q12907 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMAN2Q12907 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMAN2Q12907 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LMAN2Q12907 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMAN2Q12907 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMAN2Q12907 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMAN2Q12907 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMAN2Q12907 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMAN2Q12907 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMAN2Q12907 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LMAN2Q12907 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMAN2Q12907 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LMAN2Q12907 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LMAN2Q12907 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMAN2Q12907 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LMAN2Q12907 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMAN2Q12907 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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