Protein–RNA interactions for Protein: Q12365

BBP1, Spindle pole component BBP1, yeastyeast

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BBP1Q12365 REI1YBR267W 1182 nt3.96□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 RPB2YOR151C 3675 nt3.96□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 PPZ1YML016C 2079 nt3.96□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 KEX1YGL203C 2190 nt3.96□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 GAS4YOL132W 1416 nt3.95□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt3.95□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 YGP1YNL160W 1065 nt3.95□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 OAF1YAL051W 3144 nt3.95□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 GPI10YGL142C 1851 nt3.94□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 OSH2YDL019C 3852 nt3.94□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 NOP8YOL144W 1455 nt3.94□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 FAS2YPL231W 5664 nt3.94□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 NUP133YKR082W 3474 nt3.94□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 BUD8YLR353W 1812 nt3.94□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 SPR28YDR218C 1272 nt3.94□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 YIL028WYIL028W 399 nt3.94□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 YKL169CYKL169C 384 nt3.94□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 RCL1YOL010W 1104 nt3.94□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 YPR071WYPR071W 636 nt3.94□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 MSC2YDR205W 2175 nt3.94□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 BUD7YOR299W 2241 nt3.94□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 IKS1YJL057C 2004 nt3.94□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 MLH2YLR035C 2088 nt3.93□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 YAP1802YGR241C 1707 nt3.93□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 ARG82YDR173C 1068 nt3.93□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 LSO1YJR005C-A 282 nt3.93□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt3.93□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 IDP2YLR174W 1239 nt3.93□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 TAF11YML015C 1041 nt3.93□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 MAC1YMR021C 1254 nt3.93□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 RFA2YNL312W 822 nt3.93□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 FSH3YOR280C 801 nt3.93□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 MCM7YBR202W 2538 nt3.92□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 GIP4YAL031C 2283 nt3.92□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 CLB4YLR210W 1383 nt3.92□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 SRP72YPL210C 1923 nt3.92□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 YGL140CYGL140C 3660 nt3.92□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 SNA2YDR525W-A 240 nt3.92□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 JAC1YGL018C 555 nt3.92□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 NIS1YNL078W 1224 nt3.92□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 AIF1YNR074C 1137 nt3.92□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 ARG8YOL140W 1272 nt3.92□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 APC4YDR118W 1959 nt3.92□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 ZDS1YMR273C 2748 nt3.92□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 OPT2YPR194C 2634 nt3.91□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 PTA1YAL043C 2358 nt3.91□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 HCM1YCR065W 1695 nt3.91□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 CBP1YJL209W 1965 nt3.91□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 HIS6YIL020C 786 nt3.91□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 HCA4YJL033W 2313 nt3.91□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 YJR112W-AYJR112W-A 330 nt3.91□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 MCM2YBL023C 2607 nt3.91□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 YMR130WYMR130W 909 nt3.91□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 REX4YOL080C 870 nt3.91□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 MRM1YOR201C 1239 nt3.91□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 MFM1YPL060W 1242 nt3.91□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt3.91□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt3.91□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 YPR174CYPR174C 666 nt3.91□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 PUT2YHR037W 1728 nt3.9□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 RPO31YOR116C 4383 nt3.9□□□□□ -1.78
BBP1Q12365 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt3.9□□□□□ -1.79
BBP1Q12365 RRT7YLL030C 342 nt3.9□□□□□ -1.79
BBP1Q12365 APS1YLR170C 471 nt3.9□□□□□ -1.79
BBP1Q12365 MRPL39YML009C 213 nt3.9□□□□□ -1.79
BBP1Q12365 TOM40YMR203W 1164 nt3.9□□□□□ -1.79
BBP1Q12365 YNL296WYNL296W 315 nt3.9□□□□□ -1.79
BBP1Q12365 UTP23YOR004W 765 nt3.9□□□□□ -1.79
BBP1Q12365 FEX1YOR390W 1128 nt3.9□□□□□ -1.79
BBP1Q12365 FEX2YPL279C 1128 nt3.9□□□□□ -1.79
BBP1Q12365 RRP45YDR280W 918 nt3.89□□□□□ -1.79
BBP1Q12365 TYW3YGL050W 822 nt3.89□□□□□ -1.79
BBP1Q12365 COX4YGL187C 468 nt3.89□□□□□ -1.79
BBP1Q12365 SAE3YHR079C-A 276 nt3.89□□□□□ -1.79
BBP1Q12365 YRA2YKL214C 612 nt3.89□□□□□ -1.79
BBP1Q12365 POP3YNL282W 588 nt3.89□□□□□ -1.79
BBP1Q12365 FYV5YCL058C 459 nt3.89□□□□□ -1.79
BBP1Q12365 LDB17YDL146W 1476 nt3.89□□□□□ -1.79
BBP1Q12365 MRE11YMR224C 2079 nt3.89□□□□□ -1.79
BBP1Q12365 KIP3YGL216W 2418 nt3.89□□□□□ -1.79
BBP1Q12365 YDL027CYDL027C 1263 nt3.88□□□□□ -1.79
BBP1Q12365 RPP1AYDL081C 321 nt3.88□□□□□ -1.79
BBP1Q12365 CSM2YIL132C 642 nt3.88□□□□□ -1.79
BBP1Q12365 YKR104WYKR104W 921 nt3.88□□□□□ -1.79
BBP1Q12365 CUS2YNL286W 858 nt3.88□□□□□ -1.79
BBP1Q12365 MET12YPL023C 1974 nt3.88□□□□□ -1.79
BBP1Q12365 MEF2YJL102W 2460 nt3.88□□□□□ -1.79
BBP1Q12365 SAT4YCR008W 1812 nt3.88□□□□□ -1.79
BBP1Q12365 SWH1YAR042W 3567 nt3.88□□□□□ -1.79
BBP1Q12365 MLF3YNL074C 1359 nt3.88□□□□□ -1.79
BBP1Q12365 RSC3YDR303C 2658 nt3.88□□□□□ -1.79
BBP1Q12365 IOC2YLR095C 2439 nt3.87□□□□□ -1.79
BBP1Q12365 AAD10YJR155W 867 nt3.87□□□□□ -1.79
BBP1Q12365 OSW5YMR148W 447 nt3.87□□□□□ -1.79
BBP1Q12365 RPC19YNL113W 429 nt3.87□□□□□ -1.79
BBP1Q12365 YDC1YPL087W 954 nt3.87□□□□□ -1.79
BBP1Q12365 YPL191CYPL191C 1083 nt3.87□□□□□ -1.79
BBP1Q12365 MRPS9YBR146W 837 nt3.87□□□□□ -1.79
BBP1Q12365 RPN5YDL147W 1338 nt3.87□□□□□ -1.79
BBP1Q12365 XRS2YDR369C 2565 nt3.86□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 52.7 ms