Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
APOBRQ0VD83 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
APOBRQ0VD83 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
APOBRQ0VD83 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
APOBRQ0VD83 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
APOBRQ0VD83 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
APOBRQ0VD83 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
APOBRQ0VD83 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
APOBRQ0VD83 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
APOBRQ0VD83 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
APOBRQ0VD83 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOBRQ0VD83 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOBRQ0VD83 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOBRQ0VD83 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOBRQ0VD83 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOBRQ0VD83 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOBRQ0VD83 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOBRQ0VD83 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOBRQ0VD83 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOBRQ0VD83 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
APOBRQ0VD83 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOBRQ0VD83 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOBRQ0VD83 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOBRQ0VD83 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOBRQ0VD83 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOBRQ0VD83 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOBRQ0VD83 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOBRQ0VD83 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOBRQ0VD83 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOBRQ0VD83 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APOBRQ0VD83 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APOBRQ0VD83 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
APOBRQ0VD83 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
APOBRQ0VD83 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
APOBRQ0VD83 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
APOBRQ0VD83 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
APOBRQ0VD83 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APOBRQ0VD83 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
APOBRQ0VD83 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
APOBRQ0VD83 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
APOBRQ0VD83 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APOBRQ0VD83 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
APOBRQ0VD83 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APOBRQ0VD83 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APOBRQ0VD83 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
APOBRQ0VD83 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
APOBRQ0VD83 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APOBRQ0VD83 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
APOBRQ0VD83 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms