Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PUDPQ08623 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms