Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
LOXL1Q08397 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
LOXL1Q08397 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms