Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DEUP1Q05D60 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DEUP1Q05D60 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DEUP1Q05D60 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms