Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIN1Q05586 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GRIN1Q05586 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN1Q05586 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 603.4 ms