Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MC1RQ01726 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MC1RQ01726 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms