Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DEFA6Q01524 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA6Q01524 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms