Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
MS4A2Q01362 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MS4A2Q01362 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms