Protein–RNA interactions for Protein: P82933

MRPS9, 28S ribosomal protein S9, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS9P82933 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRPS9P82933 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPS9P82933 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms