Protein–RNA interactions for Protein: P78324

SIRPA, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRPAP78324 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRPAP78324 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRPAP78324 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRPAP78324 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRPAP78324 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRPAP78324 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRPAP78324 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRPAP78324 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRPAP78324 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRPAP78324 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIRPAP78324 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIRPAP78324 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIRPAP78324 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIRPAP78324 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIRPAP78324 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIRPAP78324 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIRPAP78324 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIRPAP78324 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIRPAP78324 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIRPAP78324 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIRPAP78324 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIRPAP78324 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIRPAP78324 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SIRPAP78324 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIRPAP78324 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIRPAP78324 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIRPAP78324 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIRPAP78324 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIRPAP78324 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIRPAP78324 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIRPAP78324 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIRPAP78324 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIRPAP78324 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIRPAP78324 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIRPAP78324 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIRPAP78324 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIRPAP78324 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SIRPAP78324 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIRPAP78324 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIRPAP78324 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIRPAP78324 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIRPAP78324 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIRPAP78324 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SIRPAP78324 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SIRPAP78324 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms