Protein–RNA interactions for Protein: P62491

RAB11A, Ras-related protein Rab-11A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11AP62491 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB11AP62491 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB11AP62491 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms