Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RPS29P62273 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
RPS29P62273 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RPS29P62273 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
RPS29P62273 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RPS29P62273 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPS29P62273 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPS29P62273 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPS29P62273 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPS29P62273 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPS29P62273 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
RPS29P62273 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPS29P62273 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPS29P62273 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPS29P62273 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPS29P62273 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPS29P62273 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPS29P62273 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPS29P62273 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPS29P62273 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RPS29P62273 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
RPS29P62273 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS29P62273 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS29P62273 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS29P62273 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS29P62273 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS29P62273 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS29P62273 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS29P62273 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS29P62273 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS29P62273 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS29P62273 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS29P62273 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS29P62273 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS29P62273 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS29P62273 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS29P62273 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS29P62273 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS29P62273 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS29P62273 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS29P62273 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS29P62273 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS29P62273 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS29P62273 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS29P62273 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS29P62273 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS29P62273 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RPS29P62273 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RPS29P62273 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RPS29P62273 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RPS29P62273 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RPS29P62273 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RPS29P62273 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RPS29P62273 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RPS29P62273 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RPS29P62273 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RPS29P62273 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RPS29P62273 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RPS29P62273 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RPS29P62273 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RPS29P62273 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RPS29P62273 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RPS29P62273 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RPS29P62273 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RPS29P62273 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RPS29P62273 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RPS29P62273 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RPS29P62273 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RPS29P62273 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RPS29P62273 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RPS29P62273 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RPS29P62273 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RPS29P62273 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RPS29P62273 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RPS29P62273 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RPS29P62273 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RPS29P62273 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RPS29P62273 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RPS29P62273 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RPS29P62273 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RPS29P62273 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RPS29P62273 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RPS29P62273 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RPS29P62273 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RPS29P62273 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RPS29P62273 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RPS29P62273 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RPS29P62273 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RPS29P62273 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RPS29P62273 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RPS29P62273 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RPS29P62273 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RPS29P62273 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RPS29P62273 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RPS29P62273 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RPS29P62273 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RPS29P62273 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RPS29P62273 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
RPS29P62273 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RPS29P62273 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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