Protein–RNA interactions for Protein: P61163

ACTR1A, Alpha-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1AP61163 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACTR1AP61163 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTR1AP61163 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms