Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ROMO1P60602 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
ROMO1P60602 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms