Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CHMP4BP1P59074 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHMP4BP1P59074 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP4BP1P59074 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms