Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC14□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC14□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms