Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LOXL3P58215 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LOXL3P58215 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms