Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJA9P57773 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJA9P57773 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJA9P57773 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJA9P57773 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJA9P57773 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJA9P57773 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJA9P57773 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJA9P57773 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJA9P57773 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJA9P57773 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJA9P57773 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJA9P57773 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJA9P57773 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJA9P57773 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GJA9P57773 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GJA9P57773 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GJA9P57773 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GJA9P57773 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GJA9P57773 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA9P57773 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA9P57773 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA9P57773 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA9P57773 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA9P57773 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA9P57773 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA9P57773 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJA9P57773 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJA9P57773 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJA9P57773 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJA9P57773 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJA9P57773 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJA9P57773 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJA9P57773 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJA9P57773 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJA9P57773 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJA9P57773 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJA9P57773 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJA9P57773 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GJA9P57773 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJA9P57773 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GJA9P57773 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GJA9P57773 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJA9P57773 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJA9P57773 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJA9P57773 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJA9P57773 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJA9P57773 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJA9P57773 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJA9P57773 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GJA9P57773 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJA9P57773 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJA9P57773 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJA9P57773 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJA9P57773 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJA9P57773 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJA9P57773 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJA9P57773 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJA9P57773 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJA9P57773 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJA9P57773 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJA9P57773 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GJA9P57773 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GJA9P57773 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJA9P57773 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJA9P57773 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJA9P57773 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJA9P57773 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJA9P57773 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GJA9P57773 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GJA9P57773 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJA9P57773 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GJA9P57773 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJA9P57773 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJA9P57773 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJA9P57773 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJA9P57773 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJA9P57773 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GJA9P57773 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJA9P57773 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJA9P57773 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJA9P57773 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJA9P57773 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GJA9P57773 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJA9P57773 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJA9P57773 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJA9P57773 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJA9P57773 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJA9P57773 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJA9P57773 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJA9P57773 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJA9P57773 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GJA9P57773 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJA9P57773 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJA9P57773 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJA9P57773 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJA9P57773 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJA9P57773 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJA9P57773 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJA9P57773 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms