Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GFRA1P56159 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GFRA1P56159 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms