Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OXCT1P55809 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OXCT1P55809 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OXCT1P55809 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms