Protein–RNA interactions for Protein: P55072

VCP, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPP55072 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VCPP55072 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VCPP55072 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VCPP55072 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VCPP55072 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VCPP55072 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VCPP55072 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VCPP55072 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VCPP55072 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VCPP55072 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VCPP55072 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VCPP55072 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VCPP55072 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VCPP55072 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VCPP55072 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VCPP55072 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VCPP55072 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VCPP55072 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VCPP55072 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VCPP55072 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VCPP55072 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VCPP55072 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VCPP55072 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VCPP55072 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VCPP55072 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VCPP55072 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VCPP55072 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VCPP55072 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VCPP55072 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VCPP55072 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VCPP55072 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VCPP55072 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VCPP55072 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VCPP55072 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
VCPP55072 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VCPP55072 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VCPP55072 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
VCPP55072 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VCPP55072 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VCPP55072 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VCPP55072 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VCPP55072 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VCPP55072 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VCPP55072 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VCPP55072 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VCPP55072 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VCPP55072 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VCPP55072 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VCPP55072 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VCPP55072 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VCPP55072 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VCPP55072 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VCPP55072 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VCPP55072 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VCPP55072 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VCPP55072 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
VCPP55072 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VCPP55072 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VCPP55072 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VCPP55072 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VCPP55072 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VCPP55072 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VCPP55072 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VCPP55072 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VCPP55072 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
VCPP55072 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VCPP55072 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VCPP55072 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VCPP55072 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VCPP55072 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VCPP55072 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VCPP55072 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VCPP55072 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VCPP55072 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VCPP55072 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
VCPP55072 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VCPP55072 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VCPP55072 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VCPP55072 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VCPP55072 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VCPP55072 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VCPP55072 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VCPP55072 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VCPP55072 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VCPP55072 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VCPP55072 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VCPP55072 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
VCPP55072 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VCPP55072 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VCPP55072 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VCPP55072 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VCPP55072 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VCPP55072 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VCPP55072 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VCPP55072 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VCPP55072 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VCPP55072 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VCPP55072 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VCPP55072 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VCPP55072 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms