Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLTPP55058 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLTPP55058 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLTPP55058 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLTPP55058 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLTPP55058 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLTPP55058 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLTPP55058 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLTPP55058 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLTPP55058 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLTPP55058 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLTPP55058 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLTPP55058 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PLTPP55058 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PLTPP55058 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PLTPP55058 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PLTPP55058 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLTPP55058 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLTPP55058 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLTPP55058 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLTPP55058 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLTPP55058 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLTPP55058 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PLTPP55058 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLTPP55058 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLTPP55058 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLTPP55058 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLTPP55058 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLTPP55058 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLTPP55058 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLTPP55058 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLTPP55058 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLTPP55058 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLTPP55058 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLTPP55058 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLTPP55058 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLTPP55058 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLTPP55058 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLTPP55058 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLTPP55058 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLTPP55058 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLTPP55058 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLTPP55058 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLTPP55058 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLTPP55058 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLTPP55058 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLTPP55058 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLTPP55058 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLTPP55058 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLTPP55058 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLTPP55058 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLTPP55058 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLTPP55058 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLTPP55058 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLTPP55058 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLTPP55058 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLTPP55058 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLTPP55058 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLTPP55058 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLTPP55058 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLTPP55058 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLTPP55058 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLTPP55058 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLTPP55058 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLTPP55058 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLTPP55058 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLTPP55058 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLTPP55058 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLTPP55058 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLTPP55058 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLTPP55058 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLTPP55058 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLTPP55058 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLTPP55058 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLTPP55058 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLTPP55058 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLTPP55058 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLTPP55058 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLTPP55058 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLTPP55058 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLTPP55058 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLTPP55058 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLTPP55058 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLTPP55058 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PLTPP55058 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLTPP55058 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLTPP55058 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLTPP55058 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLTPP55058 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLTPP55058 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLTPP55058 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLTPP55058 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLTPP55058 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLTPP55058 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLTPP55058 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLTPP55058 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLTPP55058 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLTPP55058 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLTPP55058 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLTPP55058 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms