Protein–RNA interactions for Protein: P52735

VAV2, Guanine nucleotide exchange factor VAV2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV2P52735 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VAV2P52735 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VAV2P52735 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VAV2P52735 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VAV2P52735 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VAV2P52735 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VAV2P52735 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VAV2P52735 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VAV2P52735 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VAV2P52735 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VAV2P52735 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VAV2P52735 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAV2P52735 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAV2P52735 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAV2P52735 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAV2P52735 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAV2P52735 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAV2P52735 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAV2P52735 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
VAV2P52735 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAV2P52735 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAV2P52735 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAV2P52735 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAV2P52735 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAV2P52735 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAV2P52735 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAV2P52735 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAV2P52735 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAV2P52735 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAV2P52735 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAV2P52735 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAV2P52735 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAV2P52735 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAV2P52735 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAV2P52735 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAV2P52735 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAV2P52735 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAV2P52735 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAV2P52735 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAV2P52735 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAV2P52735 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAV2P52735 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAV2P52735 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAV2P52735 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAV2P52735 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAV2P52735 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
VAV2P52735 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAV2P52735 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAV2P52735 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAV2P52735 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
VAV2P52735 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VAV2P52735 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VAV2P52735 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VAV2P52735 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VAV2P52735 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VAV2P52735 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VAV2P52735 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VAV2P52735 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VAV2P52735 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAV2P52735 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAV2P52735 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAV2P52735 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAV2P52735 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAV2P52735 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAV2P52735 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAV2P52735 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VAV2P52735 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAV2P52735 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAV2P52735 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAV2P52735 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAV2P52735 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VAV2P52735 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAV2P52735 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAV2P52735 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAV2P52735 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAV2P52735 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAV2P52735 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAV2P52735 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAV2P52735 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAV2P52735 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAV2P52735 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAV2P52735 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAV2P52735 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAV2P52735 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAV2P52735 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAV2P52735 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
VAV2P52735 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAV2P52735 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAV2P52735 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAV2P52735 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAV2P52735 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAV2P52735 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAV2P52735 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAV2P52735 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAV2P52735 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAV2P52735 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAV2P52735 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
VAV2P52735 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAV2P52735 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAV2P52735 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms