Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLCN3P51790 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLCN3P51790 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLCN3P51790 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms