Protein–RNA interactions for Protein: P50875

SPT20, Transcription factor SPT20, yeastyeast

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT20P50875 DOS2YDR068W 933 nt5.36□□□□□ -1.55
SPT20P50875 SPR28YDR218C 1272 nt5.36□□□□□ -1.55
SPT20P50875 RPS2YGL123W 765 nt5.36□□□□□ -1.55
SPT20P50875 EMC4YGL231C 573 nt5.36□□□□□ -1.55
SPT20P50875 PEX18YHR160C 852 nt5.36□□□□□ -1.55
SPT20P50875 YJL218WYJL218W 591 nt5.36□□□□□ -1.55
SPT20P50875 YMR084WYMR084W 789 nt5.36□□□□□ -1.55
SPT20P50875 SNO4YMR322C 714 nt5.36□□□□□ -1.55
SPT20P50875 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt5.36□□□□□ -1.55
SPT20P50875 YOR338WYOR338W 1092 nt5.36□□□□□ -1.55
SPT20P50875 HSP33YOR391C 714 nt5.36□□□□□ -1.55
SPT20P50875 HSP32YPL280W 714 nt5.36□□□□□ -1.55
SPT20P50875 YPR012WYPR012W 255 nt5.36□□□□□ -1.55
SPT20P50875 SUB2YDL084W 1341 nt5.36□□□□□ -1.55
SPT20P50875 PST1YDR055W 1335 nt5.36□□□□□ -1.55
SPT20P50875 MGA1YGR249W 1371 nt5.36□□□□□ -1.55
SPT20P50875 PUT1YLR142W 1431 nt5.36□□□□□ -1.55
SPT20P50875 GUA1YMR217W 1578 nt5.36□□□□□ -1.55
SPT20P50875 ATP1YBL099W 1638 nt5.36□□□□□ -1.55
SPT20P50875 TBF1YPL128C 1689 nt5.36□□□□□ -1.55
SPT20P50875 YAP1801YHR161C 1914 nt5.36□□□□□ -1.55
SPT20P50875 ERC1YHR032W 1746 nt5.35□□□□□ -1.55
SPT20P50875 REF2YDR195W 1602 nt5.35□□□□□ -1.55
SPT20P50875 RAD57YDR004W 1383 nt5.35□□□□□ -1.55
SPT20P50875 DEG1YFL001W 1329 nt5.35□□□□□ -1.55
SPT20P50875 RNY1YPL123C 1305 nt5.35□□□□□ -1.55
SPT20P50875 SUP45YBR143C 1314 nt5.35□□□□□ -1.55
SPT20P50875 YGR115CYGR115C 780 nt5.35□□□□□ -1.55
SPT20P50875 MRPS35YGR165W 1038 nt5.35□□□□□ -1.55
SPT20P50875 FOL2YGR267C 732 nt5.35□□□□□ -1.55
SPT20P50875 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt5.35□□□□□ -1.55
SPT20P50875 RFC2YJR068W 1062 nt5.35□□□□□ -1.55
SPT20P50875 SEC14YMR079W 915 nt5.35□□□□□ -1.55
SPT20P50875 MIC27YNL100W 705 nt5.35□□□□□ -1.55
SPT20P50875 NRG2YBR066C 663 nt5.35□□□□□ -1.55
SPT20P50875 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt5.35□□□□□ -1.55
SPT20P50875 UTP9YHR196W 1728 nt5.34□□□□□ -1.55
SPT20P50875 SET5YHR207C 1581 nt5.34□□□□□ -1.55
SPT20P50875 DIA3YDL024C 1407 nt5.34□□□□□ -1.55
SPT20P50875 snR7-LsnR7-L 214 nt5.34□□□□□ -1.55
SPT20P50875 SCM3YDL139C 672 nt5.34□□□□□ -1.55
SPT20P50875 DAS2YDR020C 699 nt5.34□□□□□ -1.55
SPT20P50875 OCA6YDR067C 675 nt5.34□□□□□ -1.55
SPT20P50875 YHR214WYHR214W 612 nt5.34□□□□□ -1.55
SPT20P50875 UIP3YAR027W 708 nt5.34□□□□□ -1.55
SPT20P50875 YAR066WYAR066W 612 nt5.34□□□□□ -1.55
SPT20P50875 TEM1YML064C 738 nt5.34□□□□□ -1.55
SPT20P50875 SAS2YMR127C 1017 nt5.34□□□□□ -1.55
SPT20P50875 ECM13YBL043W 774 nt5.34□□□□□ -1.55
SPT20P50875 PFA3YNL326C 1011 nt5.34□□□□□ -1.55
SPT20P50875 MDJ2YNL328C 441 nt5.34□□□□□ -1.55
SPT20P50875 YOR114WYOR114W 885 nt5.34□□□□□ -1.55
SPT20P50875 CIN2YPL241C 807 nt5.34□□□□□ -1.55
SPT20P50875 TEL2YGR099W 2067 nt5.34□□□□□ -1.55
SPT20P50875 VTC2YFL004W 2487 nt5.34□□□□□ -1.56
SPT20P50875 YEH1YLL012W 1722 nt5.34□□□□□ -1.56
SPT20P50875 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.34□□□□□ -1.56
SPT20P50875 SMP1YBR182C 1359 nt5.33□□□□□ -1.56
SPT20P50875 GEX1YCL073C 1848 nt5.33□□□□□ -1.56
SPT20P50875 GEX2YKR106W 1848 nt5.33□□□□□ -1.56
SPT20P50875 YDL057WYDL057W 987 nt5.33□□□□□ -1.56
SPT20P50875 MDH3YDL078C 1032 nt5.33□□□□□ -1.56
SPT20P50875 BUD30YDL151C 582 nt5.33□□□□□ -1.56
SPT20P50875 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt5.33□□□□□ -1.56
SPT20P50875 DON1YDR273W 1098 nt5.33□□□□□ -1.56
SPT20P50875 CBP4YGR174C 513 nt5.33□□□□□ -1.56
SPT20P50875 GIC1YHR061C 945 nt5.33□□□□□ -1.56
SPT20P50875 YJL193WYJL193W 1209 nt5.33□□□□□ -1.56
SPT20P50875 YKL071WYKL071W 771 nt5.33□□□□□ -1.56
SPT20P50875 GCD7YLR291C 1146 nt5.33□□□□□ -1.56
SPT20P50875 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt5.33□□□□□ -1.56
SPT20P50875 RPN13YLR421C 471 nt5.33□□□□□ -1.56
SPT20P50875 YNL013CYNL013C 378 nt5.33□□□□□ -1.56
SPT20P50875 PLP2YOR281C 861 nt5.33□□□□□ -1.56
SPT20P50875 CAR1YPL111W 1002 nt5.33□□□□□ -1.56
SPT20P50875 YPL261CYPL261C 309 nt5.33□□□□□ -1.56
SPT20P50875 RNR3YIL066C 2610 nt5.33□□□□□ -1.56
SPT20P50875 KTR7YIL085C 1554 nt5.33□□□□□ -1.56
SPT20P50875 TKL1YPR074C 2043 nt5.33□□□□□ -1.56
SPT20P50875 SAG1YJR004C 1953 nt5.33□□□□□ -1.56
SPT20P50875 UGO1YDR470C 1509 nt5.33□□□□□ -1.56
SPT20P50875 UBA1YKL210W 3075 nt5.32□□□□□ -1.56
SPT20P50875 BCS1YDR375C 1371 nt5.32□□□□□ -1.56
SPT20P50875 SSK1YLR006C 2139 nt5.32□□□□□ -1.56
SPT20P50875 IDP1YDL066W 1287 nt5.32□□□□□ -1.56
SPT20P50875 RSM28YDR494W 1086 nt5.32□□□□□ -1.56
SPT20P50875 MF(ALPHA)2YGL089C 363 nt5.32□□□□□ -1.56
SPT20P50875 SEH1YGL100W 1050 nt5.32□□□□□ -1.56
SPT20P50875 SRB5YGR104C 924 nt5.32□□□□□ -1.56
SPT20P50875 YGR226CYGR226C 210 nt5.32□□□□□ -1.56
SPT20P50875 SOL3YHR163W 750 nt5.32□□□□□ -1.56
SPT20P50875 SDS3YIL084C 984 nt5.32□□□□□ -1.56
SPT20P50875 DJP1YIR004W 1299 nt5.32□□□□□ -1.56
SPT20P50875 MTC2YKL098W 1074 nt5.32□□□□□ -1.56
SPT20P50875 YKR047WYKR047W 306 nt5.32□□□□□ -1.56
SPT20P50875 GAT3YLR013W 426 nt5.32□□□□□ -1.56
SPT20P50875 STM1YLR150W 822 nt5.32□□□□□ -1.56
SPT20P50875 SSP120YLR250W 705 nt5.32□□□□□ -1.56
SPT20P50875 YLR334CYLR334C 381 nt5.32□□□□□ -1.56
SPT20P50875 YLR374CYLR374C 390 nt5.32□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.8 ms