Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GATMP50440 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GATMP50440 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GATMP50440 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GATMP50440 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GATMP50440 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GATMP50440 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GATMP50440 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GATMP50440 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GATMP50440 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GATMP50440 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GATMP50440 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GATMP50440 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GATMP50440 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GATMP50440 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GATMP50440 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GATMP50440 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GATMP50440 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GATMP50440 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GATMP50440 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GATMP50440 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GATMP50440 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GATMP50440 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GATMP50440 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GATMP50440 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GATMP50440 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GATMP50440 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GATMP50440 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GATMP50440 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GATMP50440 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GATMP50440 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GATMP50440 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GATMP50440 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GATMP50440 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GATMP50440 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GATMP50440 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GATMP50440 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GATMP50440 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GATMP50440 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GATMP50440 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GATMP50440 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GATMP50440 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GATMP50440 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GATMP50440 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GATMP50440 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GATMP50440 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GATMP50440 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GATMP50440 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GATMP50440 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GATMP50440 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GATMP50440 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GATMP50440 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GATMP50440 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GATMP50440 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GATMP50440 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GATMP50440 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GATMP50440 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GATMP50440 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GATMP50440 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GATMP50440 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GATMP50440 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GATMP50440 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GATMP50440 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GATMP50440 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GATMP50440 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GATMP50440 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GATMP50440 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GATMP50440 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GATMP50440 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GATMP50440 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GATMP50440 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GATMP50440 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GATMP50440 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GATMP50440 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GATMP50440 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GATMP50440 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GATMP50440 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GATMP50440 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GATMP50440 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GATMP50440 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GATMP50440 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GATMP50440 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GATMP50440 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GATMP50440 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GATMP50440 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GATMP50440 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GATMP50440 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GATMP50440 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GATMP50440 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GATMP50440 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GATMP50440 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GATMP50440 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GATMP50440 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GATMP50440 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GATMP50440 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GATMP50440 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GATMP50440 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GATMP50440 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GATMP50440 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GATMP50440 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms