Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IDH3AP50213 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IDH3AP50213 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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