Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MRE11P49959 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MRE11P49959 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MRE11P49959 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MRE11P49959 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MRE11P49959 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MRE11P49959 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MRE11P49959 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MRE11P49959 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MRE11P49959 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MRE11P49959 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MRE11P49959 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MRE11P49959 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MRE11P49959 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MRE11P49959 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MRE11P49959 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MRE11P49959 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MRE11P49959 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MRE11P49959 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MRE11P49959 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MRE11P49959 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MRE11P49959 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MRE11P49959 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MRE11P49959 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MRE11P49959 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MRE11P49959 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MRE11P49959 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MRE11P49959 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MRE11P49959 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MRE11P49959 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MRE11P49959 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
MRE11P49959 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
MRE11P49959 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
MRE11P49959 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MRE11P49959 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MRE11P49959 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MRE11P49959 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MRE11P49959 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MRE11P49959 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MRE11P49959 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MRE11P49959 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MRE11P49959 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MRE11P49959 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MRE11P49959 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MRE11P49959 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MRE11P49959 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MRE11P49959 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MRE11P49959 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MRE11P49959 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MRE11P49959 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MRE11P49959 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MRE11P49959 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MRE11P49959 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MRE11P49959 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MRE11P49959 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MRE11P49959 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MRE11P49959 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MRE11P49959 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MRE11P49959 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MRE11P49959 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MRE11P49959 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MRE11P49959 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MRE11P49959 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MRE11P49959 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MRE11P49959 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MRE11P49959 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MRE11P49959 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MRE11P49959 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MRE11P49959 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MRE11P49959 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MRE11P49959 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MRE11P49959 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MRE11P49959 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MRE11P49959 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MRE11P49959 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MRE11P49959 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MRE11P49959 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MRE11P49959 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MRE11P49959 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MRE11P49959 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MRE11P49959 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MRE11P49959 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MRE11P49959 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MRE11P49959 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MRE11P49959 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MRE11P49959 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MRE11P49959 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MRE11P49959 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MRE11P49959 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MRE11P49959 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MRE11P49959 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MRE11P49959 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MRE11P49959 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MRE11P49959 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MRE11P49959 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MRE11P49959 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MRE11P49959 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MRE11P49959 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MRE11P49959 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MRE11P49959 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms